Como calcular Sequence Cobertura

estudos de enriquecimento exigem o cálculo dos dados de sequenciamento para determinar o nível de cobertura . Isso é feito principalmente com laboratórios de seqüenciamento de genes que exigem a preparação de amostras de DNA integrado e pré- enriquecimento pooling. Cálculo da cobertura sequenciamento requer o uso de variáveis ​​que incluem a cobertura de sequenciamento média , o total de alvo as bases ea eficiência enriquecimento . Realizar este cálculo é feito introduzindo todas essas variáveis ​​em uma equação . Instruções
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Escreva a equação utilizada para calcular a cobertura média de sequenciamento. Este será parecido com a cobertura desejada dividido por cobertura normalizada média . Se a cobertura desejada é 10x ea cobertura normalizada média é de 0,2 , então a cobertura média de sequenciamento é 50
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Escreva a equação utilizada para calcular a quantidade de seqüenciamento. Esta será a aparência ( bases totais direcionados ) (média de cobertura de sequenciamento ) /( eficiência enriquecimento ) = quantidade de seqüenciamento.
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Ligue 62 MB para " bases totais direcionados " e 0,65 para a " eficiência de enriquecimento . " Adicione a quantidade de cobertura de sequenciamento de 50x ea equação será parecido com (62) (50) /0.65 . O resultado da equação será de 4,8 GB de dados de sequenciamento .