"Silent Hunter 3" é um simulador de guerra submarina colocando jogadores em U-Boat alemão na Segunda Guerra. Além da escolha incomum de lutar pelos nazistas, difere de versões anteriores ao atribuir setor do oceano para patrulhar e permitir encontrar missões naturalmente. Após batalhas, precisará reabastecer munição e comida, que diminui com o tempo.