A fase final de Sonic Heroes só desbloqueia se achar as 7 emeralds nas fases de número par. Não é possível pegar emeralds até que um dos 4 times complete a fase Final Fortress. Após isso, qualquer time pode pegar. Todas emeralds são obtidas da mesma forma: ache uma chave (key) na fase para acessar o Special Stage. No Special Stage, persiga a emerald para pegá-la.