Não há diferença, realmente. Os termos "Sixaxis" e "Dualshock" referem-se ao mesmo controlador usado no PlayStation 3.
Veja por que os nomes podem ser confusos:
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Seiseixos: Este nome enfatiza a tecnologia de detecção de movimento integrada do controlador (usando acelerômetros e giroscópios). Foi inicialmente usado para os primeiros controladores de PlayStation 3 lançados.
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Dualshock: Este nome refere-se ao design clássico do controlador PlayStation com dois manípulos analógicos. Foi transportado da era PlayStation 2 e, eventualmente, a Sony começou a usar "Dualshock 3" para se referir aos controladores PS3, incorporando o aspecto de detecção de movimento do nome "Sixaxis".
Essencialmente, "Sixaxis" e "Dualshock 3" referem-se ao mesmo controle para o PlayStation 3. As diferenças estão principalmente no marketing e nas convenções de nomenclatura. Se você vir um controlador PS3 rotulado como “Sixaxis”, ele ainda possui os dois manípulos analógicos e é o mesmo controlador rotulado como “Dualshock 3”.
