Em todos os jogos "Pokémon", as Pokébolas são a chave para capturar Pokémon, desde os mais comuns como Magikarp até os mais raros como Arceus. Nos jogos originais, os jogadores só podiam escolher entre alguns tipos básicos de Pokébolas. Em jogos posteriores, tipos especiais foram introduzidos, cada um otimizado para capturar Pokémon em certos ambientes ou situações.
As Poké Bolas básicas vermelhas e brancas ficam disponíveis no início do jogo, mas são relativamente fracas. Capturam muitos Pokémon de nível baixo sem dificuldade. Tornam-se limitadas em utilidade conforme você progride. Great Balls, vermelhas, brancas e azuis, têm taxa de captura ligeiramente melhor. Ultra Balls, pretas, brancas e amarelas, são ainda mais poderosas. Todas três estão disponíveis para compra em quase qualquer loja Pokémon. Se comprar 10 Poké Bolas básicas de uma vez, ganha uma Premier Ball grátis. Estas têm a mesma taxa de captura das Poké Bolas normais, mas aparência diferente.
Master Balls oferecem a melhor taxa de captura de qualquer tipo. Quando usadas, nunca falham em capturar o alvo. São brancas, roxas e rosas, com um grande "M" branco na frente. Jogadores geralmente recebem uma Master Ball após completar um evento especial, como ganhar todas as insígnias de ginásio ou derrotar um chefe. Em alguns jogos, apenas uma Master Ball está disponível. Em outros, jogadores podem ganhar mais Master Balls acertando todos os números na loteria.
Nest Balls são projetadas para Pokémon selvagens fracos. Estas bolas brancas, verdes e amarelas funcionam melhor quanto mais fraco o alvo. Dive Balls, brancas, azul claro e azul escuro, funcionam melhor quando usadas debaixo d'água. Se usadas em outro local, sua taxa de captura cai para a de uma Poké Ball normal. Net Balls, brancas, turquesa e pretas, têm maior chance de capturar Pokémon do tipo Água ou Inseto.
Timer Balls vermelhas, brancas e pretas são mais eficazes após 10 turnos de batalha. A taxa de captura aumenta ligeiramente a cada 10 turnos adicionais. Quick Balls, brancas, amarelas e azul claro, funcionam melhor quando usadas no início da batalha. Repeat Balls, com design branco, vermelho, amarelo e preto, funcionam melhor em espécies de Pokémon que o jogador já capturou antes.
Capturar um Pokémon em uma Luxury Ball preta, dourada e vermelha aumenta a felicidade do Pokémon. A felicidade é importante, pois alguns Pokémon só evoluem quando felizes. Dusk Balls verdes, vermelhas e pretas funcionam bem à noite ou dentro de cavernas. Quando um Pokémon é capturado em uma Heal Ball rosa, branca e azul, sua vida é restaurada automaticamente e é curado de alterações de status. Safari Balls só estão disponíveis para uso na Safari Zone, um jogo onde você paga para capturar Pokémon raros em um ambiente tipo zoológico.