Em "Pokémon SoulSilver", você forma equipes de até seis Pokémon para batalhar contra outros treinadores e criaturas selvagens. Sua equipe é composta por Pokémon capturados ou obtidos em eventos do jogo. Pode carregar seis por vez; excedentes vão para o depósito automaticamente. A equipe começa a se formar assim que você recebe seu primeiro Pokémon no início do jogo.
Ande por áreas onde Pokémon selvagens aparecem (grama alta, cavernas, água, certos prédios) até ser atacado. Grama alta é o habitat mais comum, encontrada fora da maioria das cidades e rotas.
Enfraqueça o Pokémon atacante usando golpes dos seus Pokémon. Não reduza HP a 0, ou desmaiará e será impossível de capturar. Use golpes que causem "Sono" ou "Paralisia", se possível. Pare quando a barra de HP ficar vermelha. Se desmaiar, continue procurando.
Selecione "Itens" no menu de batalha. Escolha uma Pokébola para arremessar. Se o Pokémon estiver suficientemente fraco, ficará na bola e entrará para sua coleção. Se não tiver Pokébolas, volte à cidade mais próxima e compre na Loja de Itens.
Visite qualquer Centro Pokémon. Acesse o PC na parede, selecione "PC do Bill" para ver Pokémon guardados. Deposite os indesejados da equipe ativa. Retire os que quer adicionar à equipe.