Em "Pokémon SoulSilver", os jogadores podem obter fósseis usando o HM Rock Smash em rochas quebráveis encontradas por todo o jogo. Existe uma chance aleatória de que uma rocha quebrada revele um fóssil. "Pokémon SoulSilver" apresenta dois tipos diferentes de fósseis: o Fóssil Raiz e o Fóssil Doma. Levando os fósseis ao museu na Cidade Pewter, os jogadores podem reviver o Fóssil Raiz no Pokémon Kabutops, e podem reviver o Fóssil Raiz no Pokémon Lileep.