"Pokémon Pearl" oferece aos jogadores avançados um segundo desafio chamado "Fight Area". Porém, para explorar a nova região, você deve ter a National Pokédex. A National Pokédex é concedida a jogadores que capturaram os primeiros 150 Pokémon da região de Sinnoh. Pokémon estão espalhados pelo jogo, e levará muitas horas para encontrar e capturar todos. Uma vez feito isso, Professor Rowan lhe dá a National Pokédex, e as pessoas bloqueando a Rota 225 na Fight Area irão embora.
Capture todos os 150 Pokémon da região de Sinnoh para ganhar sua Pokédex. Verifique áreas de grama alta e cavernas em todo o jogo para encontrar Pokémon elusivos, e ouça o que outros personagens dizem sobre Pokémon na região. Alguns Pokémon podem ser obtidos através de ovos, trocas e evolução.
Volte ao Professor Rowan em Sandgem Town. Fale com ele, e ele lhe dará a National Pokédex.
Volte à Fight Area, seja usando um Pokémon com "Fly" ou pegando o navio em Snowpoint City. As pessoas bloqueando o caminho para a Rota 225 terão ido embora.