Embora o Nintendo DSi tenha apenas um slot para cartão SD, você pode usar um cartão microSDHC se tiver o adaptador adequado. Muitos cartões microSD vêm com adaptador, mas também pode comprar um online ou em lojas de informática. Existem algumas limitações quanto aos tipos de arquivos e funções que você pode usar no cartão SD com o Nintendo DSi.
O termo "SDHC" (SD High Capacity) define cartões de memória flash que armazenam de 4 GB a 32 GB. Existem quatro classes de cartões microSDHC: classe 2, 4, 6 e 8. A classe 8 é a mais rápida e a classe 2 a mais lenta; a classe 2 deve ser suficiente para uso com o Nintendo DSi. No entanto, quanto menor a classe, mais lentos serão os tempos de transferência e carregamento. Cartões SD com muitos arquivos podem travar no DSi.
Para usar um cartão microSDHC com seu DSi, você precisará de um adaptador de cartão SD. Esses adaptadores têm o formato de um cartão SD, com um pequeno slot para o cartão microSD. Ao inserir o microSD no adaptador, o conjunto inteiro cabe em qualquer slot compatível com SD e funciona como um cartão SD. Não é necessário um adaptador especial para microSDHC. O DSi suporta cartões de até 32 GB, embora use "blocos" para medir espaço em vez de gigabytes. Um bloco no DSi representa 128 KB; um cartão de 32 GB teria 262.144 blocos.
Com o Nintendo DSi, você pode armazenar fotos tiradas com o DSi e visualizá-las no menu de fotos. Também pode ouvir arquivos de música compatíveis — embora não possa armazenar gravações feitas com o DSi — e armazenar dados baixados da DSi Shop. Se tiver jogos salvos no cartão SD, também pode armazenar os dados de save do jogo no cartão.
O Nintendo DSi só lida com fotos tiradas no próprio sistema; não suporta fotos carregadas no cartão do seu computador ou de outra câmera. Se estiver usando o DSi para ouvir música, precisará de arquivos de áudio codificados no padrão AAC, com extensão M4A, MP4 ou 3GP.