"SpongeBob SquarePants: The Battle for Bikini Bottom" segue o protagonista da série de TV enquanto tenta impedir os robôs nefastos de Plankton de invadir sua cidade submersa. No jogo, jogadores podem usar SpongeBob e seus amigos Patrick e Sandy para aventurar pela cidade, coletar itens e lutar contra robôs de Plankton. O jogo também oferece códigos de cheat e exploits úteis que facilitam a luta.