Existem três fases secretas em "Lego Indiana Jones: The Original Adventures". Desbloqueie a Cidade Antiga coletando todos os artefatos no episódio Templo da Perdição, desbloqueie o Depósito coletando todos os artefatos no episódio A Última Cruzada e desbloqueie a fase Jovem Indiana Jones coletando todos os artefatos no episódio Os Caçadores da Arca Perdida.
Uma versão Lego de Han Solo da franquia "Star Wars" pode ser desbloqueada coletando as cinco figuras escondidas de Star Wars. Leia está no episódio Templo da Perdição, R2-D2 no episódio A Última Cruzada e C-3PO, Chewbacca e Luke estão no episódio Os Caçadores da Arca Perdida. Após encontrar as cinco, Han Solo será desbloqueado e acessível na tela de seleção de personagens.
Personagens podem ser desbloqueados digitando a senha correta na sala de aula de matemática da universidade. Insira os seguintes códigos:
Outros recursos podem ser desbloqueados na tela de senha da sala de aula de matemática: