"Epic Mickey" é um jogo que dá aos jogadores controle sobre Mickey Mouse e permite que tomem decisões morais. Os jogadores viajam pela Terra dos Personagens Esquecidos — chamada de Terra Desolada (Wasteland) — e usam um pincel para desenhar e apagar várias partes do jogo. A história começa com Mickey Mouse brincando na oficina do feiticeiro Yen Sid, onde ele acidentalmente derrama tinta em um modelo da Disneylândia, criando a Mancha Sombria (Shadow Blot), que ele deve eventualmente derrotar.
Viaje por todos os níveis de "Epic Mickey" até chegar à Torre da Perda (Loss Tower). Suba a escada em espiral na torre, escalando pelo lado de fora. Pinte os arcos da escada, criando plataformas. Chegue à saliência mais à direita e dê um pulo duplo até o topo das plataformas que pintou.
Entre no centro cercado e derrote os splatters e o varredor (sweeper) para abrir um portão oposto. Continue subindo a torre. Pinte plataformas quando necessário para subi-las.
Chegue ao topo da Torre da Perda, onde a Mancha Sombria está localizada.
Tente atravessar a passarela para a saída e a Mancha Sombria a derrubará. Volte pela torre e a Mancha o fará cair até o fundo. Corra por um corredor desmoronando. Use thinner na parede à esquerda e pule para uma varanda externa. Pinte as engrenagens à esquerda do lustre. Pule através dos lustres.
A parede à esquerda desmorona. Pule para um corredor estreito. Pinte várias saliências e pule rapidamente por elas antes que tentáculos da mancha rompam a parede.
Vire à esquerda. Pule no lustre para evitar os tentáculos. Pule para o próximo lustre e desça para o corredor desmoronando. Pule sobre os próximos dois lustres, pois eles ficarão desequilibrados se você pousar neles. Dirija-se ao Centro de Controle de Fogos de Artifício (Fireworks Control Center), onde acabará dentro da besta.
Uma vez dentro da besta, pule pelas plataformas no rio de thinner. Alcançe os bloticles que seguram o coração de Mickey. Pule para baixo e estoure as pústulas verdes espalhadas pela área. A maior parte do tempo será gasta destruindo estas.
Suba as plataformas à direita de Oswald, estourando bolhas verdes pelo caminho. Quando todas estourarem, o bloticle afundará longe do coração de Mickey. Vá à câmara do coração.
Localize bolhas por toda a área e jogue tinta/thinner nelas para que recuem.
Estoure o último bloticle e liberte o coração de Mickey da Mancha Sombria.