No jogo Epic Mickey para Wii, seu jogo é salvo automaticamente em vários pontos. Não é possível salvar manualmente. Quando salvo, um logotipo aparece no canto superior esquerdo avisando. Ao reiniciar, seu personagem retoma no local onde foi salvo. Realizar certas tarefas, como derrotar um Slobber, pode disparar o auto-save.
Completar uma missão ou fase. Ex: o jogo salva quando Mickey chega à tela do projetor após chegar ao topo do pé de feijão.
Coletar item importante, como Pin ou E-ticket. Pins são dados por completar tarefas, como libertar gremlin no Castelo da Beleza Sombria. E-tickets estão em baús pelo jogo.
Completar ponto principal da história, como Batalha da Rua Média ou Batalha de Ventureland. Na maioria, precisa derrotar inimigo (bloticles) para avançar.