Yu-Gi-Oh! Ultimate Masters World Championship Tournament para Game Boy Advance permite que duelistas participem de duelos virtuais e aprimorem suas habilidades. Os jogadores assumem o papel de um novo participante no Torneio Mundial e ganham Duelist Points (DP) para comprar pacotes virtuais de cartas. Os fãs então montam decks personalizados para superar o modo história ou desafios de habilidade.
O jogo fornece uma mão específica de cartas e uma mesa cheia de monstros, magias ou armadilhas do oponente. O jogador deve resolver o quebra-cabeça jogando cartas específicas. Bônus de DP variam de 200 a 1.000. Completar duelos desbloqueia mais puzzles até aparecer "Limited Duels".
Enfrente oponentes virtuais que impõem grande desvantagem. Regras mudam: apenas monstros de certo nível ou proibição de magias/armadilhas. Derrotar desafiantes rende 500 a 2.500 DP. Também desbloqueia "Theme Duels".
Exigem objetivo específico para vencer. Variam de oponentes com 10.000 de vida a causar 8.000 de dano em um ataque. Rendimento: 1.000 DP ou mais baseado nos desafios.
Permite jogar contra oponentes até sua vida chegar a zero. Cada oponente derrotado dá 1.000+ DP, aumentando conforme mais competidores aparecem. Oponentes ciclam, sem limite rígido de DP disponível.