No início de "Pokémon Ruby", o Professor Birch dá ao jogador uma Pokédex de Hoenn. Durante a jornada, o Professor Birch espera que ele complete a Pokédex. Como nos jogos anteriores, para completar a Pokédex Regional, você deve capturar todo Pokémon e não apenas vê-los. Uma vez que você mostre a Pokédex de Hoenn completa ao Professor Birch, ele lhe dará a Pokédex Nacional. Não há recompensa por completar a Pokédex de Hoenn, exceto o Diploma do Game Designer, mas muitos jogadores fazem isso pelo senso de realização.
Capture todo novo Pokémon que encontrar em sua jornada. Não espere até depois de derrotar a Liga Pokémon para começar a trabalhar na sua Pokédex de Hoenn. Sempre mantenha 20 a 30 Ultra Balls com você sempre que viajar para uma nova área.
Resista à vontade de derrotar um Pokémon Lendário como Groudon e Latios. Se você derrotar um Pokémon Lendário, não poderá capturá-lo. Pokémon Lendários em "Pokémon Ruby" são difíceis de obter, mas você deve capturá-los se quiser completar a Pokédex de Hoenn. Salve o jogo antes de batalhar contra um Pokémon Lendário, caso o derrote ou perca contra ele.
Troque com pessoas que tenham "Pokémon Sapphire" e "Pokémon Emerald". Cada jogo da terceira geração tem Pokémon exclusivos. Por exemplo, você só pode capturar Kyogre, Lotad e Sableye em "Sapphire" e "Emerald". Você deve obter Pokémon exclusivos de "Sapphire" e "Emerald" para completar a Pokédex de "Ruby".
Evolua Pokémon como Ralts, Bagon e os três iniciais. Existem certos Pokémon que você só pode obter evoluindo outros. Por exemplo, você pode capturar Trapinch facilmente na natureza. No entanto, não pode capturar Vibrava, sua evolução, na natureza. Você deve evoluir Trapinch para obter Vibrava na sua Pokédex.
Fale com todos os personagens não-jogadores em "Pokémon Ruby". Alguns personagens oferecerão Pokémon raros em troca de outro Pokémon. Uma garotinha em Pacifidlog Town oferecerá um Corsola por um Bellossom.