"Yu-Gi-Oh!: The Sacred Cards" é um jogo longo que tarefa os jogadores com obter seis cartas localizadoras para competir nas finais do torneio Battle City. Obter as primeiras cinco cartas é fácil, mas encontrar a sexta e última carta pode ser difícil, especialmente se você não souber onde procurar. Os jogadores devem passar por várias batalhas para obter esta carta.
Jogue o modo "História" (Story) do jogo até desbloquear o aquário como área para visitar. Você desbloqueará o aquário depois de derrotar Strings em um duelo na ponte.
Vá para o aquário. Você encontrará um homem chamado Mako lá dentro que não aceitará seu desafio de duelo. Mako tem a sexta e última carta localizadora em sua posse, mas você deve derrotar todos os outros duelistas no aquário antes que ele concorde em batalhar com você. Há quatro duelistas no total para derrotar.
Derrote todos os quatro duelistas. Todos os duelistas no aquário, exceto Joey, usam monstros de atributo água, então você deve carregar seu deck com monstros de atributo trovão (thunder).
Derrote Mako em um duelo para receber sua sexta e última carta localizadora. Mako também usa monstros de atributo água, então contra-ataque com monstros de atributo trovão e tenha cuidado com sua carta de armadilha Torrential Tribute, que pode nocautear todos os seus monstros no campo de uma só vez se você a ativar acidentalmente.