"G.I. Joe: The Rise of Cobra" para PlayStation 2 recria a ação do filme de 2009 de mesmo nome, colocando as heroicas forças G.I. Joe contra a organização terrorista Cobra. O jogo inclui 12 personagens jogáveis G.I. Joe, mas completar certas tarefas com sucesso pode desbloquear quatro personagens ocultos da Cobra. Você pode até inserir códigos secretos para acessar uniformes clássicos de dois dos heróis mais populares, Duke e Scarlett.
Embora retratado como recruta novato no filme, Conrad Hauser, codinome Duke, é o segundo em comando sob Hawk na continuidade padrão de G.I. Joe. Para acessar o uniforme clássico do Duke do desenho e linha de brinquedos, que apresenta camisa bege e calças verdes, pressione "Esquerda", "Cima", "Quadrado", "Cima", "Direita" e "Triângulo" no menu inicial. Inserir o código corretamente produz um efeito sonoro "Yo Joe!". Você pode então escolher Duke em seu uniforme clássico como personagem jogável na tela de seleção.
Shana "Scarlett" O'Hara, a primeira personagem feminina na linha de bonecos G.I. Joe, é conhecida por seu cabelo vermelho marcante e precisão letal com a besta. Para acessar o traje clássico amarelo e cinza da Scarlett, pressione "Direita", "Cima", "Baixo", "Baixo" e "Triângulo" no menu inicial. Novamente, um efeito sonoro "Yo Joe!" indica que o código foi inserido corretamente, e a Scarlett clássica torna-se um personagem selecionável.
O letal assassino ninja da Cobra, Storm Shadow veste-se todo de branco, sendo a contraparte maligna do heróico Snake Eyes, que veste todo preto. Storm Shadow prefere lutar com espada ou outra arma de lâmina e o enfrenta em combate ao longo do jogo. Você deve derrotá-lo na fase Ártico, na fase Deserto e na fase Selva. Se vitorioso nas três ocasiões, poderá comprar Storm Shadow por 15 pontos para desbloqueá-lo como personagem jogável.
Após terminar o jogo, você ganha acesso a missões especiais da Cobra. Completar estas missões desbloqueia Firefly, especialista em explosivos e sabotagem da Cobra; a Baronesa, oficial de inteligência e femme fatale da Cobra; e Destro, um nefasto fabricante de armas que usa uma máscara de aço sobre toda a cabeça. Cada personagem oculto da Cobra custa 15 pontos para desbloqueá-los totalmente como jogáveis. Você pode escolher usar dois personagens da Cobra em missões ou misturar um da Cobra com um G.I. Joe para criar parcerias interessantes.