Uma série japonesa de RPG que posteriormente se tornou um anime, Medabots se passa no Japão do século XXII, onde quase todos possuem seu próprio robô. A Medabot Corporation fabrica esses robôs, conhecidos como Medabots. Na verdade, os Medabots são sobreviventes de uma antiga civilização guerreira que obtêm poder de medalhas especiais. Vários personagens no jogo tentam controlar os robôs para seus próprios propósitos.
O protagonista da história, Ikki Tenryou, é um garoto de 10 anos que sonha em ter seu próprio robô e se tornar campeão do Torneio Mundial de Robatalha, que coloca robôs em combate. Ikki consegue economizar dinheiro suficiente para comprar um robô chamado Metabee, que ganha poderes especiais quando Ikki encontra uma medalha rara no rio. Juntos, Ikki e Metabee formam uma amizade confiável.
Abordagem de "metal beetle" (besouro de metal), Metabee é um Medabot do tipo Besouro Hércules amarelo que ganhou poderes e uma atitude combativa quando seu amigo Ikki o equipou com uma medalha rara. Metabee possui um arsenal de mísseis teleguiados e excelentes táticas de revólver. Apesar de nem sempre concordar com Ikki, Metabee demonstra lealdade inabalável ao seu dono.
Um funcionário de loja de conveniência aparentemente humilde, Henry é o adolescente que vendeu Metabee para Ikki. Mas Henry esconde segredos: ele é uma ex-estrela do Torneio Mundial de Robatalha e seu alter ego é o Renegado Fantasma, uma figura heroica que sai à noite para coletar medalhas raras de Medabots. Poucos imaginariam que Henry e o Renegado Fantasma são a mesma pessoa.
Erika, uma garota de 10 anos e boa amiga de infância de Ikki, trabalha no jornal da escola e está sempre em busca da próxima grande reportagem. Erika tem tendência a ser mandona, o que irrita Ikki, mas ela também possui um Medabot chamado Brass que atua como sua cinegrafista e a protege o tempo todo.
Uma garota rica e bonita, Karin estuda em escola particular e conquista o coração de quase todos os garotos, incluindo Ikki. Graças à sua riqueza, Karin possui um Medabot chamado Neutranurse com poder especial de cura, tornando-o quase invencível em batalha. Karin também é sobrinha do Dr. Aki, especialista em tecnologia Medabot.
Um garoto rico e mimado, Koji estuda na mesma escola particular de Karin e a considera sua namorada, embora sua natureza gentil e generosa mal combine com a personalidade dele. Koji é extremamente protetor com Karin e intensamente ciumento, especialmente para mantê-la longe de Ikki. Koji também possui um Medabot resistente chamado Sumilidon que vence a maioria das lutas.
Samantha, Spyke e Sloan formam Os Parafusos, uma gangue de encrenqueiros na Riverview Junior High de Ikki. Samantha, uma garota durona que secretamente gosta de coisas femininas, lidera o grupo, mandando no medroso Spyke e no preguiçoso Sloan como capangas inúteis. Samantha possui um Medabot chamado Peppercat com grande agilidade.