O controle do Nintendo GameCube compartilha muitas semelhanças com controles de consoles Nintendo anteriores, como Nintendo 64 e Super Nintendo. Jogar jogos do Mario no GameCube é simples como saber utilizar totalmente o controle. Existem vários tipos de jogos do Mario para GameCube, mas os dois mais populares são Super Mario Sunshine e Mario Kart: Double Dash!
Use o "C-stick" amarelo para mover ângulos de câmera, e mova Mario com o analógico cinza. Também use o analógico para subir cordas.
Pressione o botão verde "A" para pular. Para pulo triplo, pressione "A" três vezes rápido. Para pulo giratório, gire o analógico e pressione "A". Mova analógico esquerda/direita e pressione "A" para cambalhota. Corra em direção a parede pressionando "A" para wall kick.
Pressione "B" para falar com personagens e pegar itens. Também use "B" para arremessar objetos, abrir portas e puxar objetos.
Segure "A" para acelerar o kart. Uma vez dirigindo, use o analógico para mover o kart.
Pressione "B" para frear e dar ré.
Pressione "X" ou "Y" para arremessar qualquer item coletado.
Pressione "L" ou "R" para derrapar (drift) ao dirigir.
Pressione "Z" para trocar personagens com outro jogador. Ambos devem pressionar "Z" simultaneamente.