Em Pokémon SoulSilver, você recupera a Orbe Vermelha e a devolve à Torre Embutida, lar de Kyogre, Groudon e Rayquaza. Após capturar Groudon, ainda há passos para obter os três lendários.
O Kyogre necessário só existe em Pokémon HeartGold. Repita o processo de Groudon no HeartGold: vá à Torre Embutida, batalhe e capture Kyogre, depois transfira para seu SoulSilver (ou troque com outro jogador).
Volte ao Professor Oak em Pallet Town com Kyogre e Groudon no seu time. Ele lhe dará a Orbe Jade, complemento da Orbe Vermelha (SoulSilver) e Orbe Azul (HeartGold). A Orbe Jade libera Rayquaza.
Retorne à Torre Embutida na Rota 47 (mesmo local de Groudon/Kyogre). Leve Rock Climb e Surf. Com a Orbe Jade no inventário, Rayquaza aparecerá no lugar dos outros.