Jogadores de "Pokémon: SoulSilver", um remake da versão original "Silver", percorrem duas regiões. Os jogadores ainda precisam ganhar insígnias de ginásio e construir um time forte de Pokémon para progredir e eventualmente batalhar contra o rival do jogador. Enquanto títulos anteriores de "Pokémon" começavam na região de Kanto, os jogadores devem ganhar insígnias para desbloqueá-la em "SoulSilver".
Os jogadores começam em New Bark Town na região de Johto. Derrote o líder de ginásio em Violet City, que fica a noroeste de Cherrygrove City, pela Insígnia Zephyr. Vá pela Rota 32 até Azalea Town e vença o líder de ginásio lá pela Insígnia Hive. Vá para a Rota 34 até Goldenrod City e vença o líder no Ginásio de Goldenrod City pela Insígnia Plain. Vença o líder no Ginásio de Ecruteak City pela Insígnia Fog.
A última metade de Johto tem mais quatro batalhas. Vença Chuck em Cianwood City, a sudoeste de Olivine City, pela Insígnia Storm. Vá para nordeste até Olivine City para obter a Insígnia Mineral, depois para leste até Mahogany Town pela Insígnia Glacier. A insígnia final, a Insígnia Rising, está disponível através do Dragon's Den de Blackthorn City.
Ensine a pelo menos um Pokémon as habilidades Whirlpool, Waterfall e Surf para estar preparado para os treinadores que você enfrentará no caminho para Kanto. Pegue a Rota 26, a nordeste de Tohjo Falls, para a Rota 23. Continue para norte até a Victory Road e depois para Indigo Plateau. Derrote a Elite Four lá para continuar para Kanto, onde você pode ganhar mais oito insígnias.
Vermillion City, Saffron City, Celadon City e Cerulean City têm ginásios onde os jogadores podem ganhar as Insígnias Thunder, Marsh, Rainbow e Cascade, respectivamente. Em Fuchsia City, a sudoeste de Kanto, derrote a líder de ginásio Janine e seus Pokémon do tipo psíquico pela Insígnia Soul. Enfrente o especialista em tipo pedra Brock em Pewter City para obter a Insígnia Boulder, e Blaine na Ilha Seafoam pela Insígnia Volcano. Seu "rival" está em Viridian City. Vença-o para obter a Insígnia Earth.