"Mario & Luigi: Bowser's Inside Story" é a terceira parcela da série RPG "Mario & Luigi" e a segunda a ser lançada no Nintendo DS. No jogo, os personagens titulares, Mario e Luigi, se veem encolhidos a um tamanho microscópico e ingeridos por Bowser para encontrar a cura para uma doença conhecida como "Blorbs". Bowser está sendo controlado por outro vilão, Fawful, e assim os irmãos podem resgatá-lo do controle de Fawful assim que chegarem a Toad Town.
Vá para os Túneis de Toad Town com Mario & Luigi no tamanho normal.
Entre na quarta câmara dos Túneis de Toad Town e pegue qualquer cano de warp para ir para Toad Town.
Caminhe em direção ao cano amarelo na superfície. Uma breve cena ocorrerá na qual Mario e Luigi aprendem o golpe Canhão Você-Quem.
Continue por Toad Town derrotando inimigos e coletando qualquer equipamento que vir. Ao chegar ao final de Toad Town, você iniciará uma breve batalha contra Bowser, que ainda está sob o controle de Fawful. Derrote-o para reentrar em seu interior e procurar Fawful.