Em "Pokémon Mystery Dungeon: Blue Rescue Team", você joga como Pokémon, não como treinador. A evolução funciona diferente dos jogos principais. Para evoluir Mudkip, deve atender certos requisitos; ele evoluirá para Marshtomp, que aprende três golpes adicionais: Terremoto, Tiro de Lama e Água Lodosa.
Jogue até derrotar o chefe final.
Mude para seu Mudkip e torne-o o único Pokémon no seu grupo.
Vá para a Caverna Luminosa, ao norte da Praça da Cidade em Lago Wishcash.
Caminhe até o cristal brilhante e fale com ele. Ele perguntará se deseja evoluir. Escolha "Sim" e seu Mudkip evoluirá.