Entre na Floresta da Morte após a primeira parte do exame Chuunin. É a grande área arborizada — a segunda maior no mapa — logo fora de Konoha. Assista à longa cena, depois vá em frente a partir da área inicial. Vá para a esquerda para pegar Pílulas Chinesas de Chakra, depois volte à bifurcação e vá para a direita. Pule no primeiro galho de árvore que vir neste caminho para obter Pílulas de Comida Super Brand.
Volte ao caminho principal pulando do galho e continue até outro galho — pule nele para Armadura Super Heaven. Desça e vá para a direita, ignore o próximo galho e vá para nordeste.
Continue pelo caminho linear, ignorando todos os galhos, até chegar à Garra de Falcão. Volte ao segundo galho desta área e desça. Caminhe até o fim para obter Pílulas Versáteis Super Brand. Volte à bifurcação e vá à direita para encontrar Pílulas de Comida Toad Brand.
Volte ao primeiro galho e desça, ignorando o primeiro caminho. Desça até encontrar um símbolo da Vila da Folha. Continue para encontrar a Muramasa. Volte ao Símbolo da Folha e salve para uma cena.
Assista à cena, permita que a primeira batalha prossiga sem fazer nada pois seus personagens estão paralisados. Assista outra cena, depois lute contra Orochimaru. Assista à cena pós-batalha, então você controla Sakura. Volte ao Símbolo da Vila da Folha para salvar, depois progrida para outra cena.
Batalhe os Ninja do Som com Rock Lee. Use Sakura para manter HP do time, mas não gaste muito Chakra. Como a primeira batalha, você não tem controle real — Rock Lee assume e vence por você. Assista outra cena, depois lute contra os Ninja do Som de verdade. Outra cena ocorre e Shikamaru se junta à batalha.
Lute contra os Ninja do Som novamente, assista outra cena, depois lute com Sasuke e Sakura. Assista Sasuke ficar berserk em outra cena antes dos Ninja do Som fugirem. Assista à cena final desta parte da Floresta da Morte, depois vá ao Símbolo da Vila da Folha para salvar.
Vá para o primeiro caminho que leva para baixo e siga para nordeste para sair da área e ver outra cena. Eventualmente, Kabuto, um dos outros ninjas do exame Chuunin, se junta ao grupo e ensina a quebrar rochas. Leia as instruções na tela para aprender. Vá para a direita e quebre as rochas para encontrar um ovo cozido. Saia da área.
Vá para a direita ao carregar a tela e quebre as rochas com a nova habilidade. Pule no primeiro galho que vir e vá para sul. Pule no próximo galho, depois desça ao chão. Continue até encontrar um terceiro galho, pule nele. Pule deste galho para o chão do outro lado. Salve e saia da área para ver uma cena.
Assista à cena, depois lute contra os Ninja da Chuva com Naruto, Sasuke e Sakura. Quando a batalha terminar, outra cena ocorre. Quando terminar, vá para noroeste para encontrar um Símbolo da Vila da Folha e dois baús pequenos. Abra-os, vá para a direita para encontrar um Pergaminho Rasgado. Vá para leste, depois norte para sair da Floresta da Morte. No mapa mundial, mova sua kunai para a área a noroeste da Floresta da Morte para chegar ao templo na Torre da Floresta da Morte.