Como entrada na série "Metal Gear Solid", "Peace Walker" coloca jogadores nas botas de Big Boss enfrentando nova leva de inimigos pesadamente armados, embora modo história não seja única forma. Além do jogo principal, "Peace Walker" dá 128 desafios extras. Alguns são desafios de tiro, outros batalhas de chefes complexas. Para desbloquear Extra Ops, deve jogá-los, e cada Extra Op completado desbloqueia outro.
Jogue jogo principal até vencer Missão 26, "Batalha Peace Walker 3". Após esta, deve começar Extra Ops para progredir na história.
Complete Extra Ops começando com 14. Isso desbloqueia 22, que desbloqueia 67. Cada nova missão desbloqueia outra, mas não em ordem numérica.
Continue desbloqueando Extra Ops. Missão 98 é uma das últimas 15 desbloqueadas, e é desbloqueada vencendo Extra Op 37.