O PSP roda jogos eBOOT, enquanto o PlayStation 3 roda jogos ISO. Esta incompatibilidade torna difícil rodar jogos de PSP no PlayStation 3 ou jogos de PlayStation 3 no PSP. Modders de jogos que buscam uma maneira de superar esta restrição podem transformar arquivos eBOOT em arquivos ISO com um programa de terceiros, permitindo que o novo arquivo ISO rode no PlayStation 3.