"X-Men Mutant Academy" foi lançado para PlayStation em 2000. Escolha entre seis X-Men e quatro personagens da Irmandade para criar seu avatar virtual que representará você nos modos Story, Academy, Survival e Versus. A seleção de personagem é a mesma em qualquer modo. Por padrão, os quatro personagens da Irmandade devem ser desbloqueados para uso.
Selecione um modo de jogo no menu principal.
Selecione um personagem e pressione "X" no controle para confirmar.
Pressione "Esquerda" ou "Direita" para selecionar uma roupa. Pressione "X" na roupa escolhida e o modo carregará.
Desbloqueie personagens da Irmandade completando o modo Arcade. Na primeira conclusão desbloqueia Toad, depois Mystique, Sabretooth e por fim Magneto na quarta vez. Deve usar um personagem diferente em cada jogada do Arcade para desbloquear um novo.