Há 13 caveiras escondidas na campanha. Alteram a jogabilidade: algumas dificultam (quase obrigatórias para achievements de pontuação), outras facilitam (reduzem pontos) ou não afetam. Podem ser pegas em qualquer dificuldade, mas para manter desbloqueada deve ser pega no Normal ou acima.
Após voar pelo nível, entra numa estrutura Forerunner com corredor longo dividido por 3 salas (3 seções). O corredor tem 7 anéis (um por Halo). O 4º anel é onde Halo: Combat Evolved se passa, sendo reparado no Arco. Contagem começa no início do corredor:
Pular nos anéis na ordem certa desbloqueia a IWHBYD Skull. Ativá-la muda falas de Marines e inimigos (ex: ao matar um Brute, o parceiro grita "He was my lover!" e entra em berserk). Diálogos principais não mudam.
Se correto, todos os anéis piscam em sequência (não acontece em split-screen). A caveira aparece na plataforma onde encontra o Profeta da Verdade. Se ainda não o encontrou, assista à cutscene antes de pegar a caveira.