Há muitos objetivos a cumprir antes de considerar "Pokémon Sapphire" totalmente concluído. Embora este título de Game Boy Advance seja um jogo de final aberto sem um final definido, sempre há missões para completar. Com 386 Pokémon diferentes para coletar e treinar, você passará muitas horas jogando. Além das missões do jogo, você pode trocar Pokémon raros e batalhar com amigos.