Em "Pokémon Emerald", Latios e Latias vagam pelos céus de Hoenn. Ambos são Dragão/Psíquico e fogem quando humanos se aproximam, então ninguém jamais conseguiu capturá-los. Após derrotar a Elite Quatro, você escolhe se Latios ou Latias aparece em Hoenn. Se encontrar o Pokémon elusivo e não capturá-lo na hora, ele fugirá. É possível capturá-lo se tiver Master Ball ou Pokémon com golpe especial.