Rayquaza é o chefe final no GBA Pokémon Mystery Dungeon: Red Rescue Team. Espera no topo da Sky Tower no último capítulo. Tem 600 HP — batalha difícil. Focando nas fraquezas, dá para vencer. Preparação adequada e boa estratégia são essenciais. Não há Pokémon "certo" ou "errado", mas alguns tipos facilitam.
Suba o nível do time até todos estarem no intervalo 30–35. Abaixo disso, Rayquaza derrota seu time antes de causarem dano sério.
Dê pelo menos 5 Reviver Seeds (Sementes Reviver) a cada Pokémon. Se desmaiar, revive com vida e poder cheios. Após uso, vira semente comum.
Equipe com item de alcance como Silver Spike (Espinho de Prata) — arremessado no inimigo para dano à distância. Mínimo 25 unidades para efeito. Dê Oran Berries também — restauram só 100 HP, mas são mais baratas que Reviver Seeds.
Dê 2 Link Boxes (Caixas de Link) para que Pokémon combinem golpes. Se não tem, compra na loja por 900 Poké. Leve pelo menos 4 Sleep Seeds (Sementes de Sono) para dormir Rayquaza.
Use golpes de Gelo como Ice Beam — Rayquaza é fraco contra eles. Arremesse itens de longo alcance (Silver Spikes) para mantê-lo longe. Jogue Sleep Seeds quando chegar perto para dano fácil enquanto dorme. Oran Berries protegem de golpes pesados como Dragon Claw.
Use golpes linkados (linked moves) quando Rayquaza chegar muito perto. Escolha um ataque de cada Pokémon para combinar em dano maior.