Em Pokémon Sapphire, Rayquaza é um dos Pokémon raros e lendários que você pode capturar. Este Pokémon do tipo Dragão e Voador reside no topo do Sky Pillar, uma torre labiríntica cheia de armadilhas. Rayquaza está no nível 70 quando encontrado, então apenas equipes muito fortes têm chance. Ao capturar Rayquaza, você ganha acesso a alguns dos golpes mais poderosos do jogo, como Hyper Beam e Dragon Pulse.
Vá a Pacifidlog Town. Caminhe até a praia e use Surf para norte em direção às rochas.
Surfe entre as rochas até alcançar outra praia. Saia da água e entre no Sky Pillar à sua frente.
Atravesse o primeiro conjunto de portas e suba ao segundo andar. Abra o inventário e equipe a Mach Bike.
Siga o caminho e não pare de se mover. Se parar, o chão quebra e você cai; terá que voltar ao início e subir a torre novamente.
Vá para a esquerda. Evite bater na parede no fim do caminho. Vá para norte logo ao se aproximar da parede. Vire à direita no próximo cruzamento e passe pela porta para chegar ao terceiro andar.
Atravesse o corredor e passe pela porta para o quarto andar. Dirija a bicicleta ligeiramente à direita e vá para sul. Vá para esquerda e depois sul novamente. Vá para esquerda e depois norte.
Pare a bicicleta em uma das áreas rachadas do chão; isso fará você cair para o terceiro andar. Vá em frente e passe pela porta para entrar em uma área diferente do quarto andar.
Suba as escadas e passe pelas próximas duas portas para chegar ao último andar, onde Rayquaza espera. Aproxime-se de Rayquaza e fale para iniciar a batalha. Lute com um Pokémon do tipo Gelo, se tiver; Rayquaza é muito fraco contra Gelo. Capture jogando Ultra Balls, como faria com qualquer Pokémon de alto nível.