Juan, líder final de ginásio em Pokémon Emerald, fica em Sootopolis, mas só após completar toda a quest principal até aquele ponto. O caminho da 7ª insígnia até a porta do ginásio de Juan é longo, mas necessário pois seus Pokémon são fortes e você precisará subir de nível.
Complete toda a quest principal até a 7ª insígnia (ginásio de Mossdeep City).
Vá ao Space Center, lute contra membros da Team Magma e fale com Steven para juntar-se a ele contra Maxie.
Vá a Ever Grande City e mergulhe perto da entrada. Entre na caverna, ache submarino, suba e explore. Derrote membros da Team Aqua. Siga caminho nebuloso até grande Pokémon; aproxime-se para lutar contra Archie.
Vá para Sootopolis após Steven sair. Vá esquerda até parede de rochas, depois cima até poder virar esquerda novamente. Vire e contorne a cidade no sentido horário até a parte sul. Use Mergulhar (Dive) e entre na caverna na próxima tela.
Salve ao entrar na caverna e suba para ver cutscene de Kyogre vs Groudon. Fale com Steven, siga-o à Cave of Origin. Siga caminho linear até Wallace. Fale com Wallace, saia da caverna e fale com Steven.
Use mapa para voltar à Route 129 (perto de Seafloor Cavern, onde lutou contra Team Aqua). Siga caminho linear, lutando contra treinadores, até Route 130. Continue seguindo trilha de treinadores até achar caminho entre rochas. Entre para achar o Sky Pillar.
Fale com Wallace e siga-o à entrada do Sky Pillar. Suba caminho linear ao topo para achar Rayquaza, que voa. Voe de volta a Sootopolis para outra cutscene.
Fale com Archie e Maxie (bloqueando a porta do ginásio), eles desaparecerão. Fale com Steven e depois Wallace. Com a porta desbloqueada, pode finalmente entrar no ginásio e enfrentar Juan, último líder do jogo.