O Mundo Estrela era um conjunto especial de fases, geralmente desbloqueado ao encontrar uma saída secreta em uma fase específica e abrir um caminho para uma estrela de teleporte. As cinco fases formavam uma estrela, e cada uma conectava a uma estrela de teleporte que servia como atalho entre os mundos. As fases do Mundo Estrela eram o único lugar para obter os Yoshis azul, vermelho e amarelo e usar suas habilidades únicas. A única forma de avançar de uma fase do Mundo Estrela para a próxima e criar atalhos eficazes era vencê-las usando as saídas secretas escondidas em cada fase.
Ao completar todas as fases do Mundo Estrela usando tanto saídas secretas quanto normais, os jogadores desbloqueavam um mundo único chamado "Mundo Especial". Este consistia em oito das fases mais difíceis do jogo, cada uma com nome baseado em gírias para algo impressionante como "Incrivel" e "Legal". Ofereciam diversos tipos de fases tirados de outros mundos. Apresentavam dificuldade extrema e podiam ser infinitamente frustrantes. Ainda assim, completá-las era necessário para 100% de conclusão. Ao terminar, desbloqueavam não só uma estrela de teleporte para a Ilha Yoshi, mas também o modo "Mundo Alternativo".
O Mundo Alternativo é a recompensa por completar o Mundo Especial. Em vez de conceder um mundo novo, ele altera o mapa da Terra dos Dinossauros com uma paleta de cores totalmente nova. As mudanças se estendem a áreas como a Cúpula de Baunilha e a Floresta da Ilusão, embora as fases mantenham suas cores originais. Três inimigos ganharam sprites alterados: Koopa padrão, Planta Piranha Saltitante e Bill Balas. Koopas ganharam máscara, Plantas Piranha viraram abóboras saltitantes e Bill Balas viraram Bill Pidgit.
A Área Ultra Secreta é desbloqueada em Donut Plains ao encontrar a saída secreta na Casa Fantasma de Donut. Diferente da maioria das fases, é uma área de preparação. Consiste de um único quadro com cinco caixas de itens. As duas à esquerda contêm Cogumelos ou Flores de Fogo; as duas à direita, Cogumelos ou Penas de Capa. A do meio contém um Yoshi. Se o jogador entrou montado em Yoshi, esta caixa dava um Cogumelo Verde 1-Up. Jogadores podiam usar esta área para se preparar para fases difíceis, especialmente as do Mundo Estrela e Mundo Especial.
Os Palácios dos Interruptores são fases menos secretas. Permitem "ligar" blocos coloridos no mundo do jogo que eram apenas contornos pontilhados. Esses blocos davam acesso a novas áreas, enquanto restringiam outras. Cronometrar bem o uso de um Palácio era chave para 100%, pois as mudanças eram permanentes.
Cada mundo de "Super Mario World" abrigava várias fases e áreas secretas, muitas vezes acessadas por saídas secretas de fases normais. Cada fase secreta era necessária para o cobiçado 100% e desbloquear o modo Mundo Alternativo.