A diferença entre Fallout 3 e Fallout 3: Game of the Year Edition é que a última inclui todos os add-ons anteriormente disponíveis para download online ou via PlayStation Network e Xbox Live. Esses add-ons aumentam o nível máximo de 20 para 30, levam a áreas totalmente novas e oferecem muitas novas armas, armaduras e bônus de Perk.
Continua a história principal de Fallout 3. Seu personagem acorda na Cidadela curado e deve finalizar a luta contra o Enclave ou destruir a Brotherhood of Steel. Inclui a nova arma Tesla Cannon, que dispara uma enorme rajada de energia elétrica e mata a maioria dos inimigos com um tiro.
Não avança a história principal, mas dá uma nova missão com Brotherhood Outcasts. Entre na simulação de Anchorage para libertar o Alasca de exércitos chineses invasores. Completar a missão recompensa com novas armas, armaduras e um Perk chamado Covert Ops (aumenta Lockpick, Science e Small Guns). Também ganha: Gauss Rifle, Chinese Stealth Armor, Shock Sword e T-51b Winterized Power Armor.
Leva você a Pittsburgh, transformada em colônia de escravos (como um Paradise Falls em larga escala). Deve encontrar a cura para uma doença que se espalha. Pittsburgh é área nova com personagens, missões e equipamentos novos. Destaque para a Auto-Axe, um machado motorizado com ataques corpo a corpo mortais.
Não adiciona à história principal. Leva a uma nova área nos arredores do Capital Wasteland: Point Lookout, um monumento nacional. Complete até cinco missões secundárias recompensando com equipamentos como Bio-Gas Canister, Double-Barrel Shotgun, Fertilizer Shovel e Microwave Emitter.
Se encontrou a nave alienígena caída e registrou o Sinal de Socorro Alien no Pip-Boy, sabe que alienígenas fazem parte do universo Fallout 3. Este add-on o leva a bordo de uma nave alienígena da qual deve escapar devido à hostilidade dos captores. Adiciona tecnologia alienígena: Shock Baton, Drone Cannon, Alien Atomizer e o MPLX Novasurge (Pistola de Plasma única).