Após completar a masmorra Mt. Pyre durante suas aventuras em "Pokémon Emerald", você receberá um artefato que foi deixado pela nefasta, covarde e desprezível organização Team Magma antes de sua visita. Conhecido como Emblema Magma (Magma Emblem), este item permite que o portador entre no esconderijo secreto da Team Magma. No entanto, ninguém parece saber onde o esconderijo da Team Magma realmente fica. Você precisará explorar e usar sua inteligência para descobrir a localização do Esconderijo Magma (Magma Hideout) e pôr fim aos planos nefastos dos vilões.
Vá para leste de Lilycove City até chegar ao Esconderijo Aqua (Aqua Hideout). Você saberá que está no lugar certo quando vir membros da Team Aqua por toda parte, e alguns grunts guardando a caverna. Fale com os guardas da caverna para obter pistas; um guarda diz que a Team Magma está tentando despertar um Pokémon poderoso em seu esconderijo, e o outro menciona Mt. Chimney. Usando seus incríveis poderes de dedução, você agora sabe que deve ir ao esconderijo da Team Magma no Mt. Chimney.
Vá ao Mt. Chimney na porção oeste de Hoenn. A maneira mais fácil de chegar ao cume do Mt. Chimney é via teleférico na Rota 112, logo ao norte e oeste de Mauville City. Você pode lembrar de ter entrado na Rota 112 anteriormente via Fiery Path, que usou para pular o deserto. Você também usou o teleférico aqui para ir a Lavaridge Town antes no jogo.
Batalhe seu caminho para sul do cume até chegar ao Jagged Pass. Seus oponentes serão treinadores Pokémon padrão, não membros da Team Magma (ainda). Derrote-os para ganhar experiência extra para os desafios que virão. Uma vez no Jagged Pass, você poderá pular porções da montanha. Continue viajando nesta direção até o chão tremer, revelando o Esconderijo Magma. Este evento só ocorre após você obter o Emblema Magma; se você passou pelo Jagged Pass antes no jogo, passou pelo Esconderijo Magma sem saber.
Entre no Esconderijo Magma e ative o feitiço "Força" (Strength) para empurrar as rochas, abrindo o caminho. Continue em frente e explore os vários caminhos alternativos para itens e batalhas extras. Você aprenderá com muitos membros da Team Magma que a moral está no nível mais baixo; muitos se arrependem de ter se juntado. No final da masmorra, você encontrará Maxie, o chefe final do Esconderijo Magma. Seu Crobat é provavelmente seu Pokémon mais poderoso, embora você possa contra-atacá-lo facilmente com um Pokémon do tipo Elétrico próprio. Derrote-o para eliminar a Team Magma e completar a masmorra.