Em "Pokémon Mystery Dungeon: Explorers of Sky", você assume o papel de um Pokémon enquanto viaja pelo mundo, interagindo com seus companheiros Pokémon, engajando em batalhas e participando de jogos e missões secundárias. Após completar o Capítulo 20 e derrotar Primal Dialga, você deve passar no exame do Wigglytuff para se formar. A conclusão bem-sucedida do exame desbloqueia masmorras que foram bloqueadas durante todo o jogo.
Vá à sede da Guilda (Guild headquarters) no dia seguinte à derrota de Primal Dialga para a chamada da manhã (morning roll call). Fale com todos os Pokémon na praça da cidade e, conforme instruções do Wigglytuff durante a chamada, vá à Floresta Misteriosa (Mystifying Forest).
Navegue pelos 13 andares da masmorra Floresta Misteriosa, recrutando Pokémon pelo caminho. Recrute uma variedade de diferentes Pokémon para melhor preparar para a batalha. Após o Andar 13, mova-se para a clareira e siga Ursaring e Teddiursa em direção à Fonte Luminosa (Luminous Spring). Pelo caminho, você cairá em um buraco.
Selecione um Pokémon do tipo Lutador (fighting-type) para nocautear Loudred rapidamente no buraco. Continue usando Sleep Seeds (Sementes de Sono) para manter Wigglytuff fora da batalha. "Earth Power" e "Vacuum Cut" são ataques que jogadores podem usar contra múltiplos oponentes de uma vez. Ataques de tipo Gelo podem nocautear Diglett, Dugtrio e Chatot. Use um Pokémon tipo Terra contra Croagunk, tipo Fogo contra Sunflora e tipo Grama contra Corphish.
Derrote Wigglytuff por último, alternando entre usar ataques e itens que tenham efeitos de status que manterão Wigglytuff sem revidar. Você prossegue automaticamente para Luminous Spring, onde pode abrir um baú e obter o item "Perfect Apple" (Maçã Perfeita). Agora você pode acessar masmorras anteriormente bloqueadas, carregar mais itens na Treasure Bag e evoluir Pokémon na Luminous Spring.