Evoluir qualquer Pokémon em "Pokémon Mystery Dungeon: Explorers of the Sky" requer primeiro zerar o jogo. Bonsly segue o mesmo padrão evolutivo dos outros jogos "Pokémon", então após terminar "Explorers of Sky", você ainda precisará ensinar a habilidade Mimic ao seu Bonsly para evoluí-lo. Porém, se Bonsly for seu parceiro, há um método alternativo.
Zere "Explorers of Sky" derrotando Primal Dialga.
Vá à Guild do Wigglytuff e derrote Wigglytuff.
Fale com os Ursaring na guilda. Eles dirão que há algo estranho nas Luminous Springs.
Vá às Luminous Springs, onde você poderá evoluir qualquer Pokémon exceto seu parceiro.
Evolua Bonsly ensinando Mimic e entrando nas Luminous Springs.
Realize todas as instruções para evoluir todos os Pokémon em "Explorers of Sky".
Visite o andar 3 de Miracle Sea, andar 2 de Lower Crevice Cave, andar 17 de Mt. Travail, andar 14 de Spacial Rift ou andar 13 de Mystifying Forest para iniciar um evento Darkrai. Você deve ter Secret Slab ou Enigma Part na bolsa, ou Darkrai não aparecerá.
Derrote Darkrai e seus capangas.
Recrute Manaphy quando ele visitar seu grupo, na noite após derrotar Darkrai.
Complete uma ou duas missões, depois volte à Guild do Wigglytuff.
Fale com os Ursaring na Guild. Eles o direcionarão ao Marine Resort, onde você pode evoluir. Novamente, você deve ensinar Mimic ao seu Bonsly, ou não evoluirá.