Lugia, o Pokémon Mergulhador, é o primeiro lendário que você encontra em Pokémon SoulSilver. Lugia vive nas Whirl Islands, a leste de Cianwood City, no subsolo na Waterfall Basin. Você precisa obter as oito insígnias de Johto antes de acessar essa área. Após capturar Lugia, sua jornada continua em Kanto para mais oito ginásios e lendários.
Ao encontrar Lugia pela primeira vez, ele está no Nível 45. Neste ponto, Lugia já pôde aprender oito golpes por nível e reteve quatro, o máximo que um Pokémon pode manter. Esses golpes incluem: Extrasensory, Aeroblast, Rain Dance e Hydro Pump. Do Nível 46 ao 100, Lugia pode aprender mais oito golpes: Punishment, Ancient Power, Safeguard, Recover, Future Sight, Natural Gift, Calm Mind e Sky Attack.
Embora Lugia seja Psíquico/Voador, aprende golpes poderosos de Água e Dragão. No primeiro encontro, ele conhece Hydro Pump (nível 37), poder 120, precisão 80%, super eficaz contra Fogo, Terra e Pedra. Dragon Rush é eficaz contra Dragões (só vulneráveis a Gelo), útil contra o Campeão Lance no final de Johto. Lugia também tem dois golpes Voadores fortes: Aeroblast (nível 43, poder 100, precisão 95%) e Sky Attack (nível 99, poder 140, precisão 90%).
Como você captura Lugia no nível 45, perde a chance de reter golpes anteriores além dos quatro atuais. Alguns são fortes e você pode querê-los de volta. Visite o Move Maniac na casa a oeste do Centro Pokémon em Blackthorn City. Ele ensinará a Lugia qualquer golpe de nível esquecido em troca de um Heart Scale. Heart Scales são raros, mas às vezes encontrados quebrando rochas claras em cavernas e praias.
Lugia aparece em vários jogos como Diamond, Pearl e Platinum. Em SoulSilver, Lugia tem todos os golpes dos jogos anteriores, mais dois específicos de SoulSilver e HeartGold: Weather Ball (Normal, nível 1, poder 50, precisão 100%) e Dragon Rush (Dragão, nível 15, poder 100, precisão 75%).