"DS" significa "Dual Screen" (Tela Dupla). Refere-se às duas telas do console (superior: display, inferior: touchscreen resistiva) — a feature definidora de hardware que o diferenciava do Game Boy Advance e competidores.
Não há "E" ou "U" no acrônimo. Sufixos de modelo como DSi ("i" = individual, interativo, internet, câmera) e DS Lite referem-se a revisões, não ao acrônimo base.