Uma das novidades em "Grand Theft Auto: San Andreas" é a capacidade de modificar carros. Até agora, este é o único jogo da série que permite modificar veículos. Existem cinco locais de garagem: dois em Los Santos, dois em San Fierro e um em Las Venturas. Carros diferentes têm opções diferentes; nem todas as modificações estão disponíveis para todos os carros. Você só pode modificar carros na oficina correta para seu tipo de carroceria. Basta dirigir pela porta aberta da garagem correta para acessar a tela de modificações.