Mega Man Battle Network 3 foi lançado em 2003 em duas versões: "Blue" e "White". Cada título é semelhante em sua jogabilidade tática de RPG, mas varia em seu dispositivo no jogo conhecido como "Navi Customizer". O Navi ajuda os jogadores enquanto eles coletam battle chips para auxiliá-los em sua jornada. O chip Variable Sword (VarSword) auxilia na batalha criando uma variedade de efeitos quando uma sequência particular de botões é pressionada.
Pressione e segure o botão "A" para ativar o combo VarSword. Em seguida, insira rapidamente o combo específico para realizar o efeito de ataque desejado.
Insira Cima, Direita, Baixo para realizar o efeito WideSword.
Toque Esquerda, botão "B", Direita, "B" novamente para criar um Sonic Boom.
Insira Baixo, Esquerda, Cima, Direita, Baixo para realizar o ataque LifeSword.
Pressione Baixo, Baixo-Direita (diagonal), Direita, e a VarSword realizará o ataque LongSword.
Toque Esquerda, Baixo-Esquerda (diagonal), Baixo, Baixo-Direita, Direita para criar o efeito Fighter Sword.
Insira "B", "B", Esquerda, Baixo, Cima para a Elemental Sonic Wave.