Pokémon Yellow: Special Pikachu Edition expande Red/Blue com trama baseada no anime. A Poké Flauta é item-chave para acordar Pokémon dormindo. Obtém-se em Lavender Town após derrotar Jessie e James no topo da Pokémon Tower.
Vá a Lavender Town e entre na Pokémon Tower (parte leste da cidade).
Suba ao 2º andar e derrote seu rival para continuar ao 2º andar (nota: texto original diz "second floor" duas vezes; provavelmente 2º e 3º).
Suba ao 3º e 4º andares, lutando contra treinadores e Pokémon Ghost (Fantasma) como Gastly e Haunter.
Derrote o Marowak nível 30 que aparece antes das escadas para o 5º andar.
Suba ao 5º andar e lute contra Jessie e James. Cada um tem Arbok e Weezing nível 27. Derrote-os com golpes super-efetivos Terra (Ground) e Psíquico (Psychic).
Vá à parte norte da torre e fale com Sr. Fuji. Ele o levará à casa e dará a Poké Flauta como recompensa por resgatá-lo e derrotar a Team Rocket.