Mewtwo é o Pokémon mais forte nos jogos originais (Red/Blue) e nos remakes FireRed/LeafGreen, HeartGold/SoulSilver. Só aparece após zerar a história principal e cumprir requisitos extras.
Nota: Em FireRed/LeafGreen, Mewtwo é nível 70. Leve equipe nível 65+.