Em The Legend of Zelda: Minish Cap, Link deve derrotar um feiticeiro chamado Vaati após ele transformar Princesa Zelda em estátua de pedra. Para salvar a Princesa, precisará encontrar itens especiais e relíquias mágicas. Link usará uma nova ferramenta chamada "Minish Cap" para descobrir novas localizações, armas escondidas, novos inimigos e puzzles.
Equipe o Cajado de Pacci e pule ou corra de Vaati quando ele tentar acertar Link com os braços. Corra para direita ou esquerda para evitar bolas de fogo que ele jogará periodicamente.
Use o Cajado de Pacci para acertar os braços de Vaati quando emergirem do chão. Quando os braços aparecerem totalmente, corra para o topo da tela e pule na caixa de encolher. Corra de volta ao braço e entre na portinha minúscula.
Corra em direção aos globos oculares e use sua espada para acertar aquele que tem cor de olho diferente dos demais. Quando aquele globo morrer, os outros desaparecerão. Saia da sala e volte à caixa de encolher. Entre na portinha e Link crescerá ao tamanho normal.
Repita passos dois e três para destruir os braços de Vaati.
Carregue sua espada e corra direita ou esquerda para evitar ataques elétricos do Vaati sem braços.
Mova Link para o fundo da tela até ficar ao lado de quatro quadrados. Quando Vaati carregar seus quatro olhos, ande com Link pelos quatro quadrados e ele se duplicará até haver quatro Links no total.
Use sua espada carregada para rebater as quatro bolas elétricas de volta em Vaati. Corra até ele e acerte com a espada não carregada até quatro novos olhos aparecerem.
Repita passos 5, 6 e 7 para derrotar Vaati e vencer o jogo.