Diferente de sistemas modernos, onde saves ficam no disco rígido, seus saves de Super Nintendo ficam no próprio cartucho, não no console. Dentro do cartucho há uma bateria CR2032 de lítio cuja única função é manter os dados do save. Quando essa bateria morre, seu progresso não pode ser salvo, tornando alguns jogos impossíveis de terminar a menos que jogue tudo de uma vez. A CR2032 não foi feita para durar excessivamente e muitas empresas da era SNES não esperavam que seus jogos ainda fossem jogados hoje, daí a dependência da bateria.
Nem todos os jogos de SNES tinham baterias; isso pode ser porque alguns não eram longos o suficiente ou as empresas não queriam gastar mais e usavam sistema de senhas. Porém, em certos gêneros, pela duração, a bateria quase sempre estava inclusa. Incluem RPGs como "Chrono Trigger" ou "Final Fantasy III", pois a maioria tem 20-30 horas com muitas variáveis. Alguns jogos longos de plataforma como "Super Metroid" e "Super Mario World" também usam baterias. Se você precisa criar um save no início, é boa indicação de que usa bateria de lítio.
Testar se a bateria não funciona é simples. Jogue até o primeiro ponto de save, salve e desligue. Ligue e carregue. Se o save sumiu, a bateria está esgotada. Sempre teste um cartucho se possível ao comprar jogos de SNES.
Existem alguns métodos. Um é abrir o cartucho, remover a CR2032 velha e soldar uma nova. Qualquer erro mínimo pode tornar o cartucho permanentemente injogável. Pode usar fita elétrica para segurar a bateria no lugar em vez de soldar, mas a fita soltará eventualmente, não sendo solução permanente. Por fim, procure uma loja de reparos na sua região. Muitas lojas independentes oferecem serviços por uma taxa.
Enquanto alguns preferem jogar no sistema original, alternativas existem. Nintendo, SquareEnix e Capcom disponibilizam muitos jogos de SNES como downloads digitais para Wii. Podem ser baixados, jogados e salvos direto no Wii sem preocupação com bateria. Além disso, algumas empresas disponibilizam catálogos em outros sistemas. Usuários de Game Boy Advance podem jogar "Final Fantasy III", enquanto donos de PlayStation 3 podem jogar "Chrono Trigger".