"The Legend of Zelda: Spirit Tracks" continua a série Zelda no Nintendo DS. Link viaja de trem — primeiro jogo da série com esse meio. Foi o primeiro a permitir jogar como Link e Zelda. Controlar ambos é necessário para obter o Arco de Luz, essencial para derrotar o chefe final.
Entre no 18º andar da Torre dos Espíritos pela escada. Avance explodindo rochas com bombas. Vá ao canto superior esquerdo e puxe blocos que bloqueiam o caminho para a esquerda. Pise no interruptor e pegue a chave do baú. Abra a porta para o 19º andar.
Pegue a orbe no 19º andar e coloque no quadrado perto da porta. Ative o interruptor e use o bumerangue para acertar a orbe ao lado da porta, mudando sua posição para norte. Use o arco na orbe e uma ponte aparecerá levando à parte sul da sala.
Atravesse a ponte e guie o inimigo Wrecker para as rochas na nova área para ele quebrá-las. Suba as escadas ao 20º andar.
Avance pelo 20º andar. Exploda rochas, evite Phantoms e manipule orbes para apontarem na direção necessária. Quando Zelda virar Wrecker, volte ao 19º e depois ao 18º andar.
Mova o bloco azul pequeno para o topo. Faça Zelda empurrar o bloco azul grande para oeste. Link deve movê-lo o resto do caminho até repousar sobre ambos interruptores. O bloco pequeno corresponde ao interruptor pequeno no chão. Posicione os outros dois blocos azuis sobre os outros dois interruptores para obter chave. Passe pela porta trancada ao 19º andar.
Suba até o 24º andar. Use Zelda para segurar interruptores enquanto avança como Link. Ataque um Phantom para Zelda virar um, e Link pule no Phantom Zelda para passar pela lava. Acerte orbes necessárias para subir andares. Pegue a Chave Mestra no 22º andar para entrar na porta trancada do 23º. Suba escadas no 23º para chegar ao 24º.
Enfrente o chefe Byrne no 24º andar. Espere o braço (com manopla) prender no chão. Faça Zelda puxar a manopla e siga com ataques de espada de Link. Continue atingindo Byrne quando vulnerável para derrotá-lo.
Vá ao trem e vá ao Reino da Areia pelo Reino do Oceano para perseguir o chefe que fugiu. Desenhe linha no mapa na direção que as grandes estátuas olham. Vá à área de interseção onde suas quatro linhas se encontram para formar trilhos necessários ao Reino da Areia.
Entre no Templo da Areia. Mova Link à área com rochas rolando à direita. Atire flecha no olho e ataque inimigos. Pegue chave pequena do baú e abra porta trancada.
Passe pelas próximas duas portas. Evite espinhos e ataque inimigos no terceiro andar para obter a varinha de areia.
Use a varinha para avançar pelo santuário. Use sob Link para erguê-lo. Passe varinha sobre inimigos para congelá-los. Bloqueie espinhos no lugar para manobrar. Volte e crie blocos de areia no primeiro andar para mover rocha no catapulta. Use interruptor para quebrar parede, revelando escadas ao porão.
Navegue pelo porão e mova bloco azul espinhoso com varinha. Continue sul e use varinha para mover rocha no catapulta. Mova outra rocha no interruptor. Desça e vá esquerda e manipule dois blocos para abrir porta azul. Passe, derrote inimigos e erga areia na sala norte para pegar a Chave Mestra. Volte à área dos dois blocos e mova-os novamente para abrir porta rosa. Use Chave Mestra e salve.
Use catapultas para atirar rochas nos ossos do chefe Skeldritch. Após dois acertos, use bumerangue para ativar interruptor do catapulta à esquerda, e arco para ativar os dois últimos. Acerte o cérebro de Skeldritch com blocos de areia para derrotá-lo, e desça as escadas para obter o Arco de Luz.