A série "Super Mario" começou com Mario resgatando a Princesa Peach aprisionada, e a Nintendo repetiu esta premissa em muitos outros títulos. Em "Super Princess Peach", porém, os papéis são invertidos. Mario está preso numa masmorra, e a Princesa Peach deve resgatá-lo. Embora o jogo compartilhe muitos elementos de jogabilidade com outros títulos do Mario, também tem recursos únicos. Dominando estes e explorando outros, os jogadores podem tornar o jogo mais fácil.
Vibes são um recurso único de "Super Princess Peach". Permitem controlar o estado emocional da princesa. Pode deixá-la feliz, triste, zangada ou calma, e cada estado produz efeitos únicos. Por exemplo, chorar num broto de feijão fará crescer um pé de feijão, que pode então escalar. Enquanto isso, uma princesa calma recupera vida lentamente. Há um porém: a princesa tem força emocional limitada, representada pelo medidor de vibe. Se acabar, não poderá usar nenhum desses poderes até recarregar. Normalmente faz isso coletando cristais de vibe, mas há também uma abordagem secreta secundária: pise num monstro e depois pegue-o. Peach o dará ao seu guarda-chuva, ganhando vibes no processo.
Quando um goomba, inimigo em forma de cogumelo, é morto com uma casca de koopa, transforma-se numa moeda de ouro. Para ganhar dinheiro fácil, pise num koopa e pegue a casca. Percorra o mapa até ver uma fileira de goombas. Jogue a casca neles. Após matar os goombas, a casca continuará rolando para frente. Corra atrás dela. Não deixe sair da tela. Quando bater numa parede, quicará de volta. Pule por cima. Se foi longe o suficiente, os goombas terão regenerado, e a casca os matará novamente. Continue seguindo a casca de ida e volta para ganhar dinheiro fácil. Ao completar o nível, vá à loja. Com seu ouro, pode comprar novas habilidades.
Bowser é o vilão principal na maioria dos títulos do Mario, incluindo "Super Princess Peach". Enfrentará ele duas vezes no final do jogo. Cada batalha joga de forma diferente. Na primeira, sua única ofensa é o guarda-chuva. O truque é esperar até ele investir. Assim que estiver perto, pule e balance o guarda-chuva ao mesmo tempo. Acertará nele e pulará sobre o ataque simultaneamente. Tem de realizar esta sequência quatro vezes para remover um único coração. Quando ele estiver com três corações, começará a lançar bolas de fogo. Desvie e espere pela próxima investida.
Após derrotar Bowser, ele se regenera, e desta vez está ainda maior. Seu ataque de guarda-chuva é inútil contra sua pele grossa, mas felizmente ele lhe dá uma nova arma: bombas. Elas aparecem quando Bowser pisa. Pegue-as caminhando sobre elas. Espere um segundo para o pavio encurtar e então jogue-as em Bowser. Se cronometrar corretamente, explodirão justamente no contato. Após feri-lo várias vezes, ele se cercará numa bolha. Esta bolha o cura. Use o vibe de raiva de Peach para destruir a bolha antes que Bowser recupere a vida.