O Zoo Tycoon 2 original foi lançado apenas para PC, Macintosh e celular em novembro de 2004. Várias edições alternativas saíram desde então. Entre elas, Zoo Tycoon 2: Zookeeper Collection, lançada em outubro de 2006, inclui o jogo original junto com as expansões Endangered Species e African Adventure. A Zookeeper Collection apresenta várias formas de desbloquear todo o conteúdo do jogo.
Na parte Zoo Tycoon 2 da Zookeeper Collection, jogadores desbloqueiam itens diferentes completando partes específicas. O Arco de Flores (Flower Arch) é desbloqueado completando cenários da Campanha Zoológicos Problemáticos (Troubled Zoos), enquanto completar cenários da Campanha Treinamento de Zootecnista (Zookeeper in Training) desbloqueia o Flowerpost. A Campanha Panda Misterioso (Mysterious Panda) é desbloqueada completando todos os cenários da Campanha Programas de Conservação (Conservation Programs). A Estátua de Panda Dourado (Gilded Panda Statue) vem completando cenários da Campanha Panda Misterioso. A Estátua do Globo (Globe Statue) vem vencendo todos os cenários da Campanha Globo. Para a Estátua de Relógio Solar (Sundial Statue), jogue a campanha Prevenir Maus-tratos a Animais e vença cada cenário.
Na parte African Adventure, jogadores desbloqueiam temas e habilidades com truques. Para o Tema Africano, jogue e vença todos os cinco desafios do African Adventure. Vencer todos os cinco desafios de foto desbloqueia o Tema Selva (Jungle Theme).
Jogadores também ganham capacidade de correr em vez de apenas andar pressionando múltiplos botões de andar simultaneamente. Faça isso pressionando "W" e "Seta Cima" ao mesmo tempo, ou clicando com botão esquerdo do mouse enquanto segura "W" ou "Seta Cima".
Diferentes bônus são desbloqueados na parte Endangered Species ao atingir certos níveis. Cat Climber ao terminar todas as Campanhas Foto Safari. Estátua de Filhotes (Animal Babies Statue) ao localizar e reproduzir 10+ espécies ameaçadas ou criticamente ameaçadas. Jipes Decorados (Decorated Jeep Vehicles) ao atingir $250.000 em doações. Comandantes de Jipe (Jeep Commanders) ao atingir $25.000 em doações. Quiosque de Foto (Photo Kiosk) ao completar quatro Desafios de Foto. Upgrades de Carrinhos do Sky Tram ao levar 1.000 visitantes a fazer tour. Colunas Decorativas de Muro (Decorative Zoo Wall Columns) ao adotar 20+ espécies ameaçadas. Topos de Muro Decorados (Decorated Zoo Wall Caps) ao encontrar 10+ espécies ameaçadas e soltá-las na natureza.