"Return to Mysterious Island" é um jogo de quebra-cabeça e aventura que segue Mina, uma jovem acidentalmente presa na Ilha Misteriosa. Alegadamente desabitada, a ilha apresenta muitos artefatos e tecnologias antigas. Um homem oferece ajuda, mas a um preço alto. O jogo tem muitos quebra-cabeças que o jogador médio acha difíceis sem dicas.
Fazer fogo é vital à sobrevivência. Seca você, permite cozinhar comida encontrada e envia sinais de fumaça para pedir ajuda. Requer fonte, isca e combustível. A fonte pode ser sílex (flint) ou lente. Há sílex na área da praia e em uma abertura escura na falésia esquerda. Encontre o telescópio no baú do tesouro, localizado seguindo as rotas de escavação da tartaruga marinha, e use sua lente como fonte. Encontre isca procurando objetos pequenos e secos como papel, amadou e líquen. Amadou e líquen crescem em áreas úmidas como o arco da praia. Procure na floresta por toras, tábuas, carvão, galhos de palmeira e gravetos — serão seu combustível. Vá ao inventário e combine os três objetos. Virarão um objeto chamado "fogo pronto" (ready-made fire). Encontre local seco para acender. Toda vez que fizer fogo, repetirá o processo.
No início, você está exausto e com pouca vida. Quando a vida acaba, morre. A maneira mais fácil de ganhar vida cedo é achar peixes para comer. Mas primeiro precisa fazer vara de pesca. Comece combinando sua faca com um coco marrom no chão. Fará uma corda. Queime acácias para obter seus espinhos. Pegue o galho bifurcado e combine com a corda e os espinhos. Cave no chão na floresta para achar minhocas e combine com a vara. Agora tem vara pronta. Clique a vara no oceano para lançar. Ao pegar peixe, recolherá automaticamente. Cozinhe no fogo e coma para aumentar vida.
Começa na praia com objetivo de achar todos os itens lá, e pode ser um dos quebra-cabeças mais difíceis. Isso porque começa com nada e vida baixa, devendo ter muito cuidado. Ao começar, vire-se e vá à falésia. Verá um fantasma acima. Olhe para baixo, verá uma chave enferrujada. Pegue imediatamente. Vá à direita e olhe o ninho na borda da falésia. Fácil de alcançar. Pegue o ovo de pássaro. Ovo aumenta vida, mas só depois de cozido. Encontre o trânsito e pegue todos itens em sua moldura. Vá ao arco e olhe o barco. Não pode fazer nada com o barco agora. Vire à direita e pegue a alga no chão.